Dannet I København Apr 1940 lige efter besættelsen af landet. Marinebefehlshaber havde kommandoen over alle enheder under den tyskal flåde I Danmark og de omkringliggende øer, inkl. jordbaseret tropper og kystforter som var under Kriegsmarine. Marinebefhlshaber var underlagt Stationskommando Ostsee indtil 1. februar 1943, hvor den var omorganiseret og nu under Kommandierender Admiral Dänemark.
Kommandører:
Admiral Raul Mewis (08 Apr 1940-15 Apr 1941)
Kapitän zur See Hans Henning (i.V.) (16 Apr 1941-03 Jun 1941)
Admiral Raul Mewis (04 Jun 1941-31 Jan 1943)
Stabschefer:
Kapitän zur See Hans Henning (08 Apr 1940-09 Jun 1942)
Kapitän zur See Joachim von Gerlach (i.V.) (10 Jun 1942-20 Sep 1942)
Kapitän zur See Hans Henning (21 Sep 1942-00 Dec 1942)
Kapitän zur See Kurt Ihssen (00 Dec 1942-31 Jan 1943)
Stab
1. Admiralstabsoffizier
Kapitän zur See Eduard Rabe (00 May 1940-00 Oct 1942)
Kapitän zur See Dipl.Ing. Hermann Land (00 Oct 1942-31 Jan 1943)
2. Admiralstabsoffizier
Fregattenkapitän Ernst Kopp (00 Apr 1940-00 Jun 1940)
Fregattenkapitän der Reserve John Voelsch (00 Jun 1940-00 Nov 1941)
Kapitän zur See Willy Jungbecker (00 Nov 1941-31 Jan 1943)
3. Admiralstabsoffizier
Kapitän zur See Dipl.Ing. Hermann Land (00 Apr 1940-00 Oct 1942)
Korvettenkapitän der Reserve Dr. Fritz Schubert (00 Oct 1942-31 Jan 1943)
4. Admiralstabsoffizier
Kapitänleutnant Joachim Skibowski (00 Apr 1940-00 Aug 1940)
Kapitänleutnant der Reserve Dr. Ernst Krüger (00 Aug 1940-00 Nov 1940)
Korvettenkapitän der Reserve Hellmuth Roth (00 Sep 1941-31 Jan 1943)
Ing.-Referent
Korvettenkapitän (Ing.) der Reserve Dipl.Ing. Wilhelm Richter (00 Apr 1940-31 Jan 1943)
Artilleriewaffenreferent
Korvettenkapitän (W) Friedrich Böttcher (00 Apr 1940-00 Jun 1940)
Fregattenkapitän (W) z.V. Maximilian Mack (00 Jun 1940-00 May 1942)
Fregattenkapitän (W) Karl Feldhahn (00 May 1942-31 Jan 1943)
Luftschutzreferent
Kapitänleutnant M.A. der Reserve Georg Preuss (00 Aug 1942-31 Jan 1943)
Leitender Sanitätsoffizier
Geschwaderarzt Dr.med. Alfred Staby (00 May 1940-00 Jun 1940)
Marineoberstabsarzt Dr.med. Ernst Heinsius (00 Jun 1940-00 Jan 1941)
Flottenarzt Dr.med. Kurt Sander (00 Jan 1941-31 Jan 1943)
Verwaltungsoffizier
Korvettenkapitän (V) Hans Suhrcke (00 Apr 1940-00 Feb 1942)
Fregattenkapitän (V) Dr. Karl Seefeld (00 Feb 1942-31 Jan 1943)
Intendant
Marinestabsintendant Heinz von Broock (00 Apr 1940-00 Jun 1940)
Marineintendanturrat Dr.jur. Andreas Kolle (00 Aug 1940-31 Jan 1943)
P I
Kapitän zur See Siegfried Vahl (00 Jan 1941-00 Oct 1942)
Kapitän zur See Horst Rieder (00 Oct 1942-31 Jan 1943)
Gericht des Marinebefehlshabers Dänemark
Leitender Richter
Marineoberkriegsgerichtsrat Dr.jur. Wolfgang von Tabouillot (00 Dec 1940-31 Jan 1943)
Underlagte enheder:
Abschnitt dänische Westküste
Abschnitt Nordjütland
Abschnitt Südjütland und dänische Inseln
Kriegsmarinedienststelle Aalborg
Kriegsmarinedienststelle Aarhus
Kriegsmarinedienststelle Kopenhagen